Preview

Фармакогенетика и Фармакогеномика

Расширенный поиск

Экспрессия генов лейкотриеновых рецепторов LTB4R и LTB4R2 как прогностические и предиктивные маркеры рака молочной железы

https://doi.org/10.24411/2588-0527-2019-10048

Полный текст:

Аннотация

Изучение прогностического потенциала статуса экспрессии генов LTB4R/LTB4R2.

Для цитирования:


Калинкин А.И., Немцова М.В., Кузнецова Е.Б., Сигин В.О., Игнатова Е.О., Кекеева Т.В., Поддубская Е.В., Залетаев Д.В., Стрельников В.В., Танас А.С. Экспрессия генов лейкотриеновых рецепторов LTB4R и LTB4R2 как прогностические и предиктивные маркеры рака молочной железы. Фармакогенетика и Фармакогеномика. 2019;(2):16-16. https://doi.org/10.24411/2588-0527-2019-10048

Введение

Сигналинг лейкотриеновых рецепторов участвует в прогрессировании различных видов опухолей, в том числе при раке молочной железы (РМЖ). Экспрессия лейкотриеновых рецепторов LTB4R и LTB4R2 вовлечена в пролиферацию, выживание, миграцию и метастазирование раковых клеток [1]. Повышенная экспрессия LTB4R блокирует анти-пролиферативный сигналинг TGF-β1 в клеточных линиях РМЖ [2]. Эктопическая экспрессия LTB4R2 ассоциирована с повышенной инвазивностью клеток РМЖ [3]. Использование метода широкогеномного бисульфитного секвенирования ДНК позволило нам выявить аномальное деметилирование CpG-островка генов LTB4R и LTB4R2 в группе операционных образцов РМЖ [4]. Аномальное деметилирование этого CpG-островка подтвердили методом бисульфитного секвенирования по Сэнгеру [5].

Цель

Целью данной работы является изучение прогностического потенциала статуса экспрессии генов LTB4R/LTB4R2.

Материалы и методы

Экспрессионные данные RNA-seq c платформы Illumina HiSeq и клинические характеристики, включающие в себя время последнего обследования, время смерти и статус были получены с портала TCGA (The Cancer Genome Atlas) для 1083 образцов опухолевой ткани рака молочной железы различных молекулярных подтипов. Уровень экспрессии генов LTB4R/LTB4R2 был категоризован в высокий и низкий уровень с помощью метода maximally selected rank statistics. Различия между кривыми выживаемости Каплана–Мейера оценивали с помощью критерия Мантеля–Кокса. Загрузка данных и статистические вычисления проводились с помощью языка программирования R.

Результаты

Показано, что аномальное деметилирование LTB4R и LTB4R2 ассоциировано с эктопической экспрессией данных генов в образцах трижды-негативного РМЖ. Общая выживаемость была значимо снижена в группе ТН РМЖ с высокой экспрессией LTB4R, а также в группе нормально-подобных опухолей РМЖ с низкой экспрессией LTB4R и в группе LumB РМЖ с низкой экспрессией LTB4R2.

Заключение

Различные уровни экспрессии LTB4R/LTB4R2 позволяют использовать их как прогностический маркер для РМЖ, однако прогноз напрямую зависит также от молекулярного подтипа РМЖ. Возможно, уровень

экспрессии и метилирования генов LTB4R/LTB4R2 можно также использовать как предиктивный маркер чувствительности опухоли к ингибиторам лейкотриеновых рецепторов, что требует подтверждения клиническими испытаниями.

Финансирование

Работа выполнена при финансовой поддержке РНФ, проект № 18-15-00430

Литература

  1. Moore GY, Pidgeon GP. Cross-Talk between Cancer Cells and the Tumour Microenvironment: The Role of the 5-Lipoxygenase Pathway. Int J Mol Sci. 2017;18(2). pii: E236. DOI: 10.3390/ijms18020236
  2. Jeon WK, Choi J, Park SJ, et al. The proinflammatory LTB4/BLT1 signal axis confers resistance to TGF-β1-induced growth inhibition by targeting Smad3 linker region. Oncotarget. 2015 Dec 8;6(39):41650–66. DOI: 10.18632/oncotarget.6146
  3. Kim H, Choi JA, Park GS, Kim JH. BLT2 up-regulates interleukin-8 production and promotes the invasiveness of breast cancer cells. PLoS One. 2012;7:e49186. DOI: 10.1371/journal.pone.0049186
  4. Tanas AS, Sigin VO, Kalinkin AI, et al. Genome-wide methylotyping resolves breast cancer epigenetic heterogeneity and suggests novel therapeutic perspectives. Epigenomics. 2019;11(6):605–617. DOI: 10.2217/epi-2018-0213
  5. Kalinkin AI, Strelnikov VV, Ignatova EO, et al. Leukotriene B4 receptors as a therapeutic target for triple-negative breast cancer. Annals of Oncology. 2018;29(6). DOI: 10.1093/annonc/mdy314.019

Об авторах

А. И. Калинкин
ФГБНУ«Медико-Генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова»
Россия


М. В. Немцова
ФГБНУ«Медико-Генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова»; ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова (Сеченовский Университет)
Россия


Е. Б. Кузнецова
ФГБНУ«Медико-Генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова»; ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова (Сеченовский Университет)
Россия


В. О. Сигин
ФГБНУ«Медико-Генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова»
Россия


Е. О. Игнатова
ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России
Россия


Т. В. Кекеева
ФГБНУ«Медико-Генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова»
Россия


Е. В. Поддубская
ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова (Сеченовский Университет)
Россия


Д. В. Залетаев
ФГБНУ«Медико-Генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова»; ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова (Сеченовский Университет)
Россия


В. В. Стрельников
ФГБНУ«Медико-Генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова»
Россия


А. С. Танас
ФГБНУ«Медико-Генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова»
Россия


Для цитирования:


Калинкин А.И., Немцова М.В., Кузнецова Е.Б., Сигин В.О., Игнатова Е.О., Кекеева Т.В., Поддубская Е.В., Залетаев Д.В., Стрельников В.В., Танас А.С. Экспрессия генов лейкотриеновых рецепторов LTB4R и LTB4R2 как прогностические и предиктивные маркеры рака молочной железы. Фармакогенетика и Фармакогеномика. 2019;(2):16-16. https://doi.org/10.24411/2588-0527-2019-10048

Просмотров: 188


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2686-8849 (Print)
ISSN 2588-0527 (Online)