Распространённость полиморфизмов гена CYP3A4*22 (rs35599367) C>T, CYP3A5*3 (rs776746) A>G среди якутов и русских, больных лекарственно-устойчивым туберкулёзом лёгких
https://doi.org/10.37489/2588-0527-2025-3-34-44
EDN: WWFTEW
Аннотация
Обоснование. Лечение лекарственно-устойчивого туберкулёза сопряжено с множеством медико-социальных проблем, поэтому продолжается поиск мер по улучшению результатов лечения с помощью разработки новых лекарств и схем химиотерапии. Бедаквилин метаболизируется изоферментом цитохрома P450 CYP3A4. Полиморфизмы CYP3A4 и CYP3A5 могут приводить к вариабельности концентраций бедаквилина в плазме, и влиять на эффективность и безопасность лечения. В настоящее время отсутствуют данные о распространённости полиморфных вариантов гена CYP3A4*22 и CYP3A5*3 среди якутов и русских, больных туберкулёзом.
Цель. Изучить частоту носительства полиморфизмов генов CYP3A4*22 (rs35599367) C>T, CYP3A5*3 (rs776746) A>G среди якутов и русских, больных лекарственно-устойчивым туберкулёзом в сравнении с нормальной изменчивостью аллельных вариантов изучаемых генов в восточноазиатских и европейских популяциях.
Методы. Определяли полиморфизмы CYP3A4*22 (rs35599367) C>T, CYP3A5*3 (rs776746) A>G методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени.
Результаты. Частота аллеля T гена CYP3A4*22 достоверно ниже в сибирской группе по сравнению с частотой в евразийской группе (p = 0,003). Генотип дикого типа (CC) CYP3A4*22 встречался значимо чаще в сибирской группе больных, чем в евразийской группе, гетерозиготный генотип (CT) меньше представлен в сибирской популяции (p = 0,003). Генотип AA CYP3A5*3 реже встречался в сибирской группе пациентов относительно его частоты в евразийской группе (p = 0,021), гетерозиготный генотип AG намного реже выявлялся в сибирской популяции больных (p < 0,001), генотип GG преобладал в сибирской группе и реже определялся в евразийской популяции (p < 0,001). Выявлены различия распределение аллелей и генотипов CYP3A5*3 между якутами и восточными азиатами (p < 0,05).
Заключение. Различия аллельных вариантов и генотипов CYP3A4 и CYP3A5 в популяциях русских и якутов, больных лекарственно-устойчивым туберкулёзом лёгких, может существенно модифицировать клиническую эффективность и развитие нежелательных реакций при лечении бедаквилином, так в его окислении основное значение имеет изофермент CYP3A цитохрома Р450.
Ключевые слова
Об авторах
Н. М. КрасноваРоссия
Краснова Наталия Михайловна — к. м. н., доцент, Медицинский институт,
Якутск.
Конфликт интересов:
Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
В. М. Николаев
Россия
Николаев Вячеслав Михайлович — к. б. н., с. н. с.,
Якутск.
Конфликт интересов:
Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
А. С. Асекритова
Россия
Асекритова Александра Степановна — к. м. н., доцент, Медицинский институт; зав. ГАУ РС(Я) «Республиканская клиническая больница №3»,
Якутск.
Конфликт интересов:
Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Н. Е. Евдокимова
Россия
Евдокимова Надежда Евстафьевна — врач-фтизиатр, зав. центром,
Якутск.
Конфликт интересов:
Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
О. В. Татаринова
Россия
Татаринова Ольга Викторовна — д. м. н., главный врач; с. н. с.,
Якутск.
Конфликт интересов:
Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Е. С. Прокопьев
Россия
Прокопьев Егор Спиридонович — директор,
Якутск.
Конфликт интересов:
Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
А. И. Венгеровский
Россия
Венгеровский Александр Исаакович — д. м. н., профессор, заслуженный работник высшей школы РФ, профессор кафедры фармакология,
Томск.
Конфликт интересов:
Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Н. П. Денисенко
Россия
Денисенко Наталья Павловна — к. м. н., доцент, кафедра клинической фармакологии и терапии им. академика Б.Е. Вотчала,
Москва.
Конфликт интересов:
Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Д. А. Сычев
Россия
Сычев Дмитрий Алексеевич — д. м. н., профессор, академик РАН, зав. кафедрой клинической фармакологии и терапии имени академика Б. Е. Вотчала,
Москва.
Конфликт интересов:
Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Список литературы
1. Salari N, Kanjoori AH, Hosseinian-Far A, et al. Global prevalence of drug-resistant tuberculosis: a systematic review and meta-analysis. Infect DisPoverty. 2023 May 25;12(1):57. doi: 10.1186/s40249-023-01107-x.
2. Nguyen TV, Cao TB, Akkerman OW, et al. Bedaquiline as part of combination therapy in adults with pulmonary multi-drug-resistant tuberculosis. Expert Rev Clin Pharmacol. 2016 Aug;9(8):1025-37. doi: 10.1080/17512433.2016.1200462.
3. Кудлай Д.А. Разработка и внедрение в клиническую практику нового фармакологического вещества из класса диарилхинолонов. Экспериментальная и клиническая фармакология. 2021;84(3):41-47. [Kudlay DA. Development and implementation of new pharmacological agent of the diarylquinoline class in clinical practice. Experimental and Clinical Pharmacology. 2021;84(3):41-47. (In Russ.)]. DOI: 10.30906/0869-2092-2021-84-3-41-4710.14341/probl20135943-10.
4. Туберкулёз у взрослых. Клинические рекомендации. Министерство здравоохранения Российской Федерации; 2024. [Tuberculosis in adults. Clinical guidelines. Ministry of Health of the Russian Federation; 2024. (In Russ).].
5. Wang MG, Wu SQ, He JQ. Efficacy of bedaquiline in the treatment of drug-resistant tuberculosis: a systematic review and meta-analysis. BMC Infect Dis. 2021 Sep 17;21(1):970. doi: 10.1186/s12879-021-06666-8.
6. Starshinova A, Dovgalyk I, Belyaeva E, et al. Efficacy of Tuberculosis Treatment in Patients with Drug-Resistant Tuberculosis with the Use of Bedaquiline: The Experience of the Russian Federation. Antibiotics (Basel). 2022 Nov 14;11(11):1622. doi: 10.3390/antibiotics11111622.
7. Ur Rehman O, Fatima E, Ali A, et al. Efficacy and safety of bedaquiline containing regimens in patients of drug-resistant tuberculosis: An updated systematic review and meta-analysis. J Clin Tuberc Other Mycobact Dis. 2023 Dec 1;34:100405. doi: 10.1016/j.jctube.2023.100405.
8. Mallick JS, Nair P, Abbew ET, et al. Acquired bedaquiline resistance during the treatment of drug-resistant tuberculosis: a systematic review. JAC Antimicrob Resist. 2022 Mar 29;4(2):dlac029. doi: 10.1093/jacamr/dlac029.
9. Алгазина В.В., Смирнова Т.Г., Романов В.В., Эргешов А.Э. Частота встречаемости устойчивости M. tuberculosis к линезолиду и бедаквилину у пациентов за период 2011–2022 гг. Туберкулез и социально значимые заболевания. 2024;12(3):20-25. [Algazina V.V., Smirnova T.G., Romanov V.V., Ergeshov A.E. The incidence of M. tuberculosis resistance to linezolid and bedaquiline in patients for the period 2011-2022. Tuberculosis and socially significant diseases. 2024;12(3):20-25. (In Russ.)]. doi: 10.54921/2413-0346-2024-12-3-20-25
10. Shaw ES, Stoker NG, Potter JL, et al. Bedaquiline: what might the future hold? Lancet Microbe. 2024 Dec;5(12):100909. doi: 10.1016/S2666-5247(24)00149-6.
11. Lan Z, Ahmad N, Baghaei P, et al; Collaborative Group for the MetaAnalysis of Individual Patient Data in MDR-TB treatment 2017. Drugassociated adverse events in the treatment of multidrug-resistant tuberculosis: an individual patient data meta-analysis. Lancet Respir Med. 2020 Apr;8(4): 383-394. doi: 10.1016/S2213-2600(20)30047-3.
12. Тюлькова Т.Е., Ткачук А.П., Акмалова К.А., и др. Генетический полиморфизм, влияющий на метаболизм противотуберкулёзных препаратов. Фармакогенетика и фармакогеномика. 2024;(2):37-45. Doi: 10.37489/2588-0527-2024-2-37-45. EDN: FMIQSQ [Tyulkova T.E., Tkachuk A.P., Akmalova K.A., et al. Genetic polymorphisms affect the metabolism of antituberculosis drugs. Pharmacogenetics and Pharmacogenomics. 2024;(2): 37-45. (In Russ.)].
13. Elens L, van Gelder T, Hesselink DA, et al. CYP3A4*22: promising newly identified CYP3A4 variant allele for personalizing pharmacotherapy. Pharmacogenomics. 2013 Jan;14(1):47-62. doi: 10.2217/pgs.12.187.
14. Сычёв Д.А., Отделенов В.А., Денисенко Н.П., Смирнов В.В. Изучение активности изоферментов цитохрома Р450 для прогнозирования межлекарственных взаимодействий лекарственных средств в условиях полипрагмазии. Фармакогенетика и фармакогеномика. 2016;2:4-11. [Sychev DA, Otdelenov VA, Denisenko NP, Smirnov VV. The study of the activity of isoenzymes of cytochrome P450 for the prediction of drug-drug interactions of medicines in terms of polypharmacy. Pharmacogenetics and Pharmacogenomics. 2016;(2):4-11. (In Russ.)].
15. Wrighton SA, Schuetz EG, Thummel KE, et al. The human CYP3A subfamily: practical considerations. Drug Metab Rev. 2000 AugNov;32(3-4):339-61. doi: 10.1081/dmr-100102338.
16. Danielson PB. The cytochrome P450 superfamily: biochemistry, evolution and drug metabolism in humans. Curr Drug Metab. 2002 Dec;3(6):561-97. doi: 10.2174/1389200023337054.
17. Иващенко Д.В., Рыжикова К.А., Созаева Ж.А., и др. Влияние полиморфизмов генов CYP3A5, CYP2C9, CYP2C19 и CYP2D6 на профиль безопасности феназепама при синдроме отмены алкоголя. Вестник РАМН. 2018;73(3):206–214. [Ivashchenko DV, Ryzhikova KA, Sozaeva ZhA, et al. Impact of CYP3A5, CYP2C9, CYP2C19, and CYP2D6 Polymorphisms on Phenazepam Safety in Patients with Alcohol Withdrawal Syndrome. Annals of the Russian Academy of Medical Sciences. 2018;73(3): 206–214. (In Russ.)]. DOI:10.15690/vramn989.
18. Okubo M, Murayama N, Shimizu M, et al. CYP3A4 intron 6 C>T polymorphism (CYP3A4*22) is associated with reduced CYP3A4 protein level and function in human liver microsomes. J Toxicol Sci. 2013;38(3): 349-54. doi: 10.2131/jts.38.349.
19. Elens L, van Gelder T, Hesselink DA, et al. CYP3A4*22: promising newly identified CYP3A4 variant allele for personalizing pharmacotherapy. Pharmacogenomics. 2013 Jan;14(1):47-62. doi: 10.2217/pgs.12.187.
20. Scheibner A, Remmel R, Schladt D, et al. Tacrolimus Elimination in Four Patients With a CYP3A5*3/*3 CYP3A4*22/*22 Genotype Combination. Pharmacotherapy. 2018 Jul;38(7):e46-e52. doi: 10.1002/phar.2131.
21. Suarez-Kurtz G, Struchiner CJ. Pharmacogenomic implications of the differential distribution of CYP3A5 metabolic phenotypes among Latin American populations. Pharmacogenomics. 2024 Mar;25(4):187-195. doi: 10.2217/pgs-2024-0009.
22. Adler G, Uzar I, Valjevac A, et al. Genetic diversity of CYP3A5 and ABCB1 variants in East-Central and South European populations. Ann Hum Biol. 2022 Jun;49(3-4):210-215. doi: 10.1080/03014460.2022.2100477.
23. Suarez-Kurtz G, Vargens DD, Santoro AB, et al. Global pharmacogenomics: distribution of CYP3A5 polymorphisms and phenotypes in the Brazilian population. PLoS One. 2014 Jan 10;9(1):e83472. doi: 10.1371/journal.pone.0083472.
24. Adler G, et al. Landscape of CYP3A5 Variants in Central-Eastern and South European Populations. In: Badnjevic A., Škrbić R., Gurbeta Pokvić L. (eds) CMBEBIH 2019. CMBEBIH 2019. IFMBE Proceedings, vol 73. Springer, Cham. Doi: 10.1007/978-3-030-17971-7_78.
25. Wang HP, Xie JJ, Zhang ZY, et al. [Study on polymorphisms of CYP3A5 gene and their clinical role]. Zhonghua Yi Xue Yi Chuan Xue Za Zhi. 2005 Aug;22(4):423-6. Chinese.
26. Genvigir FDV, Campos-Salazar AB, Felipe CR, et al. CYP3A5*3 and CYP2C8*3 variants influence exposure and clinical outcomes of tacrolimusbased therapy. Pharmacogenomics. 2020 Jan;21(1):7-21. doi: 10.2217/pgs2019-0120.
27. Haas DW, Abdelwahab MT, van Beek SW, et al. Pharmacogenetics of Between-Individual Variability in Plasma Clearance of Bedaquiline and Clofazimine in South Africa. J Infect Dis. 2022 Aug 12;226(1):147-156. doi: 10.1093/infdis/jiac024.
Рецензия
Для цитирования:
Краснова Н.М., Николаев В.М., Асекритова А.С., Евдокимова Н.Е., Татаринова О.В., Прокопьев Е.С., Венгеровский А.И., Денисенко Н.П., Сычев Д.А. Распространённость полиморфизмов гена CYP3A4*22 (rs35599367) C>T, CYP3A5*3 (rs776746) A>G среди якутов и русских, больных лекарственно-устойчивым туберкулёзом лёгких. Фармакогенетика и фармакогеномика. 2025;(3):34-44. https://doi.org/10.37489/2588-0527-2025-3-34-44. EDN: WWFTEW
For citation:
Krasnova N.M., Nikolaev V.M., Asekritova A.S., Evdokimova N.E., Tatarinova O.V., Prokopyev E.S., Vengerovsky A.I., Denisenko N.P., Sychev D.A. Prevalence of CYP3A4*22 (rs35599367) C>T and CYP3A5*3 (rs776746) A>G gene polymorphisms among Yakuts and Russians with drug-resistant pulmonary tuberculosis. Pharmacogenetics and Pharmacogenomics. 2025;(3):34-44. (In Russ.) https://doi.org/10.37489/2588-0527-2025-3-34-44. EDN: WWFTEW
JATS XML



































