Американские ученые использовали CRISPR для редактирования ДНК вне клетки, создав основу для диагностического теста, который может воспроизводить ДНК мутации в опухоли пациента и помочь врачам определить наиболее подходящий метод лечения. Таким образом, ученые впервые предложили использовать технологию редактирования генома CRISPR для диагностики злокачественных новообразований.

Группа ученых редактировала гены внутри плазмидов, типа ДНК, который может быть удален из клетки. Исследователи использовали Cas9, однако данная система не была эффективной для редактирования ДНК вне клетки. Затем ученые обратили внимание на фермент Cas12a, к которому легче добавить фрагменты ДНК.

Во время диагностики пациентов со злокачественными новообразованиями, их опухоли часто секвенируют для того чтобы определить генетические мутации, которые запускают развитие заболевания. Система CRISPR-Cas12a может быть использована для репликации ДНК мутаций на основе информации полученной путем секвенирования. Воссоздание генетических мутаций на синтетических фрагментах ДНК дает исследователям возможность понять, какие сигнальные пути подвержены воздействию мутаций. Система CRISPR-Cas12a может также вносить многочисленные изменения в образцы ДНК за один цикл.

В настоящее время системы CRISPR могут редактировать только один отдельный ген, однако исследования ученых могут привести к использованию CRISPR для лечения таких заболеваний как болезнь Альцгеймера, где мутации содержатся в нескольких генах.

Источник: FierceBiotech, Cell-free" CRISPR could improve cancer diagnostics, unravel how gene editing works