Стандартный объем тестирования при генотипировании CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6 в лабораторной диагностике продиктован рекомендациями, разработанными Рабочей группой по фармакогеномике Ассоциации молекулярной патологии (PGxWG AMP), которые опираются в первую очередь на генетическую структуру населения западных стран.

В исследовании на основании Базы данных популяционных частот (https://nir.cspfmba.ru/info) Российской Федерации и включившем 121442 россиян из 85 субъектов нашей страны, показано, что во многом такой объем неоптимален.

📌 Ключевые положения:

👉 CYP2C9: PGxWG AMP предлагает включать в минимальный объем тестирования аллели *2, *3, *5, *6, *8,*11, при этом в общероссийской популяции аллельную частоту, превышающую 0,5% имеют аллели *2, *3, *29. Последний вариант (CYP2C9*29), характеризующийся сниженной ферментной активностью (AS = 0,5), особенно распространен в республиках Удмуртия, Татарстан, Марий Эл, Чувашия, где доля его носителей может достигать 6%. Кроме того, в республиках Дагестан и Чечня представлена аллель CYP2C9*12 (AS = 0,5), также не учтенная в рекомендациях PGxWG AMP.

👉CYP2C19: аллельная структура в российской популяции в целом соответствует принятому объему диагностики, включающему определение вариантов *2, *3, *17. Из крайне редко встречающихся в глобальных популяциях гаплотипов CYP2C19 нами был обнаружен вариант *8 (AS = 0) у жителей Ямало-Ненецкого автономного округа (0,51%) и Забайкальского края (0,58%), при этом по мировым данным аллель совсем не встречается у лиц восточноазиатского происхождения, что можно было бы ожидать с учетом географии данных регионов.

👉CYP2D6: в общероссийской популяции аллельную частоту более 0,5% имеют варианты *3, *4, *9, *10, *41, *6, *59, то есть рекомендации PGxWG АМР во многом избыточны, что может быть объяснено тем, что в них учитывается генетическая структура африканской популяции, значительно отличающаяся по полиморфизму этого фермента. В отдельных регионах России представлены также гаплотипы CYP2D6*32 (Чеченская Республика), CYP2D6*74 (Хабаровский, Забайкальский, Камчатский край), CYP2D6*117 (некоторые северные регионы – Архангельская, Вологодская, Мурманская область, Карелия, а также Тюменская область и Пермский край), которые не входят в диагностические наборы AMP. CYP2D6*32 характеризуется сниженной ферментной активностью (AS= 0,25) и практически не встречается в мировых популяциях, при этом в Чеченской Республике его распространенность превышает 1%, в Марий Эл, Чувашии, Дагестане и Кабардино-Балкарии – составляет от 0,5% до 1%. Для CYP2D6*74 и CYP2D6*117 функциональная роль не определена, что, с учетом их представленности в некоторых частях нашей страны, указывает на перспективность изучения их влияния на функцию фермента. 

🚀В статье на основании полученных данных авторы предлагают возможные диагностические панели, организованные попринципу наборов PGxWG АМР, с разделением на минимальный и расширенный. Для каждого изученного изофермента цитохрома Р450 - CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6 – предложены рекомендации по составу диагностических панелей (минимальный и расширенный наборы), актуальные для российской популяции в целом и учитывающие региональные особенности. Таким образом, работа предоставляет научно обоснованные критерии для разработки или оптимизации готовых диагностических наборов. Это открывает возможности для улучшения диагностики путем внедрения эпидемиологически обоснованного фармакогенетического тестирования в клиническую практику.

Источник: https://www.extrememedicine.ru/jour/article/view/371