<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">phgenomics</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Фармакогенетика и фармакогеномика</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Pharmacogenetics and Pharmacogenomics</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2588-0527</issn><issn pub-type="epub">2686-8849</issn><publisher><publisher-name>LLC "Izdatelstvo OKI"</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">phgenomics-28</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ЭТНИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ ФАРМАКОГЕНЕТИКИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>ETHNIC ASPECTS OF PHARMACOGENETICS</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Сравнение частоты встречаемости однонуклеотидного варианта CYP3A5*3 в этнических группах русских и нанайцев</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title></trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Грабуздов</surname><given-names>А. М.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">noemail@neicon.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Шуев</surname><given-names>Г. Н.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">noemail@neicon.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Сулейманов</surname><given-names>С. Ш.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">noemail@neicon.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-3"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Рыжикова</surname><given-names>К. А.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">noemail@neicon.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Сычёв</surname><given-names>Д. А.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">noemail@neicon.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib></contrib-group><aff xml:lang="ru" id="aff-1"><institution>ФГАОУ ВО ПМГМУ им И.М. Сеченова</institution><country>Russian Federation</country></aff><aff xml:lang="ru" id="aff-2"><institution>ФГБОУ ДПО РМАНПО</institution><country>Russian Federation</country></aff><aff xml:lang="ru" id="aff-3"><institution>Российско-японский медицинский центр «САИКО»</institution><country>Russian Federation</country></aff><pub-date pub-type="collection"><year>2017</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>12</day><month>12</month><year>2017</year></pub-date><volume>0</volume><issue>2</issue><fpage>48</fpage><lpage>49</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Грабуздов А.М., Шуев Г.Н., Сулейманов С.Ш., Рыжикова К.А., Сычёв Д.А., 2017</copyright-statement><copyright-year>2017</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Грабуздов А.М., Шуев Г.Н., Сулейманов С.Ш., Рыжикова К.А., Сычёв Д.А.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Грабуздов А.М., Шуев Г.Н., Сулейманов С.Ш., Рыжикова К.А., Сычёв Д.А.</copyright-holder><license license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.pharmacogenetics-pharmacogenomics.ru/jour/article/view/28">https://www.pharmacogenetics-pharmacogenomics.ru/jour/article/view/28</self-uri><abstract><p>Изучение частоты встречаемости однонуклеотидного варианта CYP3A5*3 (A6986G,  rs776746) в этнической группе нанайцев, сравнить с литературными данными по  встречаемости этого варианта в этнической группе русских.</p></abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>однонуклеотидный вариант CYP3A5*3</kwd><kwd>нанайцы</kwd></kwd-group></article-meta></front><body><p>Введение</p><p>Эффективность и безопасность медикаментозного лечения зависит от особенностей  фармакокинетики, фармакодинамики и метаболизма используемых препаратов.  Важную роль в метаболизме лекарственных веществ играют ферменты группы  цитохрома P450. Эти ферменты различны по своей структуре и благодаря этому  метаболизируют большую часть ксенобиотиков. Например, ген CYP3A5 участвует в  метаболизме иммуносупрессивных препаратов, антиретровирусных средств,  антигипертензивных средств из группы блокаторов кальциевых каналов. Однако  имеются данные о разной эффективности и безопасности иммуносупрессивных препаратов в аналогичных группах пациентов. Это явление  может быть вызвано присутствием в популяции различных вариантов  последовательности нуклеотидов в гене цитохрома. Так, известно, что у носителей однонуклеотидного варианта CYP3A5*3 (A6986G, rs776746) скорость работы  цитохрома снижена. В группе пациентов-носителей генотипа GG, концентрация  такролимуса была достоверно выше, чем у носителей других вариантов генотипов [<xref ref-type="bibr" rid="cit1">1</xref>].  У пациентов с генотипом GG могут более выраженно проявиться эффекты гепатотоксичности такролимуса [<xref ref-type="bibr" rid="cit2">2</xref>]. Кроме того, известны межэтнические  различия в частоте этого полиморфизма. Некоторые исследователи полагают, что  частота встречаемости CYP3A5*3 напрямую зависит от удалённости региона от  экватора. Так, в африканской популяции данный полиморфизм встречается наиболее редко (0,06 в Нигерии), а в европейской (0,96 во Франции) и  восточноазиатской популяциях (0,95 в Китае) наиболее часто [<xref ref-type="bibr" rid="cit3">3</xref>]. В связи с этим  представляет большой интерес изучение частоты данного полиморфизма в разных  этнических группах России. </p><p>Цель</p><p>Изучить частоту встречаемости однонуклеотидного варианта CYP3A5*3 (A6986G,  rs776746) в этнической группе нанайцев, сравнить с литературными данными по  встречаемости этого варианта в этнической группе русских.</p><p>Материалы и методы</p><p>Изучаемая популяция. В исследование были включены 70 здоровых добровольцев из  этнической группы нанайцев, средний возраст 43,5 лет (от 22 до 70 лет). Все  добровольцы были проинформированы о целях и методах исследования, дали своё  добровольное информированное согласие на участие в исследовании и на забор  генетического материала. Критерии включения: принадлежность добровольцев к этнической группе нанайцев,  что определялось путём самоидентификации добровольцев и их родителей [<xref ref-type="bibr" rid="cit4">4</xref>]. Критерии невключения: в исследование не включали близких родственников (братьев,  сестёр, родителей) и потомков разноэтнических браков. Генотипирование. Для определения полиморфизмов у добровольцев забрали 5 мл  венозной крови в вакуумные пробирки с реактивом ЭДТА, забор крови осуществляли  на базе амбулатории краевого ГБУ здравоохранения «Троицкая ЦРБ» МЗ Хабаровского  края, с. Найхин. Образцы в замороженном состоянии доставлены в НИЦ ФГБОУ ДПО  РМАНПО МЗ РФ, где проводили выделение ДНК из лейкоцитов крови с использованием  набора Научно-производственной фирмы «Синтол». Выделенную ДНК изучали на носительство однонуклеотидного варианта (SNV) CYP3A5*3 (A6986G, rs776746)  методом Real-Time PCR с помощью набора Научно-производственной фирмы «Синтол»  производства России, Москва, на амплификаторе RealTime CFX96 Touch (Bio-Rad  Laboratories, Inc., USA). Программа включала предварительную денатурацию при 95 °С  в течение 3 мин, затем 40 циклов: денатурация при 95 °C в течение 15 секунд, отжиг  при 63 °C в течение 40 минут. </p><p>Популяция сравнения. В качестве группы сравнения выбрали популяцию русских,  поскольку это самая крупная этническая группа в России. Набор популяции проводили  по литературным данным с использованием поисковой системы NCBI Pubmed. </p><p>Статистический анализ. Был проведён тест Харди–Вайнберга для подтверждения  независимого распределения аллелей в изучаемых полиморфизмах. Точный тест  Фишера использовали для оценки различий частот встречаемости различных аллелей  между нанайской и русской этническими группами. Статистические данные  обрабатывались в программе INSTAT.</p><p>Результаты</p><p>По данным исследования [<xref ref-type="bibr" rid="cit5">5</xref>] были обследованы 229 здоровых добровольцев из  этнической группы русских. Генотип AA по CYP3A5*3 обнаружен не был, AG встречался у 11 % (n = 25), GG у 89 %  (n = 204) обследованных, частота А аллели составила 0,05, частота G аллели 0,95. Хи- квадрат по Харди–Вайнбергу составил 0,76, р = 0,6837. У 70 здоровых добровольцев из нанайской этнической группы определили частоту  CYP3A5*3. Генотип AA встречался в 2,9 % (n = 2) случаев, AG – в 11,4 % (n = 8)  случаев, GG в 85,7 % (n = 60) случаев. Частота А аллели составила 0,09, G аллели  0,91. Хи квадрат по Харди–Вайнбергу составил 5,13, р = 0,0799. Частота носительства G аллели по CYP3A5*3 (A6986G), статистически не различалась в  группах русских и нанайцев OR = 0,62, 95 % CI [0,30–1,26], р = 0,23. </p><p>Заключение</p><p>В данном исследовании была определена частота встречаемости однонуклеотидного  варианта CYP3A5*3 (A6986G, rs776746) в этнической группе нанайцев, распределение  генотипов соответствовало закону Харди–Вайберга. Также мы сравнили частоту этого  SNV с русской популяцией по данным литературы. Мы не нашли статистически  значимых различий в частоте CYP3A5*3 (A6986G) между группами, однако наше  внимание привлекла высокая распространённость «медленных» метаболизаторов в  обеих этнических группах (частота G аллели была 0,95 у русских и 0,91 в нанайской  этнической группе). Более высокая концентрация цитостатиков у носителей генотипа  GG может приводить к развитию гепатотоксичности [<xref ref-type="bibr" rid="cit1">1</xref>]. Фармакогенетические исследования в этой области могут способствовать  персонализации режимов дозирования для пациентов, принимающих препараты- субстраты CYP3A5. Кроме того, полученные результаты могут помочь в принятии решений о внедрении фармакогенетического тестирования в клиническую  практику на территории Российской Федерации. </p><p>Литература</p><p>1. Xue F., Han L., Chen Y., Xi Z., Li Q., Xu N. et al. CYP3A5 genotypes affect tacrolimus pharmacokinetics and infectious complications in Chinese pediatric liver transplant patients, 2014 Mar, 18 (2): 166–76.2. Thompson E.E., Kuttab-Boulos H., Witonsky D., Yang L., Roe B.A., Di Rienzo A. CYP3A Variation and the Evolution of Salt-Sensitivity Variants. Am J Hum Genet, 2004 Dec, 75 (6): 1059–1069.3. Yasmina A., Deneer V.H., Maitland-van der Zee A.H. et al. Application of routine electronic health record databases for pharmacogenetic research. J Intern Med, 2014, 275 (6): 590–604.4. Hua Tang, Tom Quertermous, Beatriz Rodriguez et al. Genetic Structure, Self-Identified Race/Ethnicity, and Confounding in Case-Control Association Studies. Am. J. Hum. Genet, 2005, 76: 268–275.</p></body><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Xue F., Han L., Chen Y., Xi Z., Li Q., Xu N. et al. CYP3A5 genotypes affect tacrolimus pharmacokinetics and infectious complications in Chinese pediatric liver transplant patients, 2014 Mar, 18 (2): 166-76.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Xue F., Han L., Chen Y., Xi Z., Li Q., Xu N. et al. CYP3A5 genotypes affect tacrolimus pharmacokinetics and infectious complications in Chinese pediatric liver transplant patients, 2014 Mar, 18 (2): 166-76.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Thompson E.E., Kuttab-Boulos H., Witonsky D., Yang L., Roe B.A., Di Rienzo A. CYP3A Variation and the Evolution of Salt-Sensitivity Variants. Am J Hum Genet, 2004 Dec, 75 (6): 1059-1069.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Thompson E.E., Kuttab-Boulos H., Witonsky D., Yang L., Roe B.A., Di Rienzo A. CYP3A Variation and the Evolution of Salt-Sensitivity Variants. Am J Hum Genet, 2004 Dec, 75 (6): 1059-1069.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Yasmina A., Deneer V.H., Maitland-van der Zee A.H. et al. Application of routine electronic health record databases for pharmacogenetic research. J Intern Med, 2014, 275 (6): 590-604.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Yasmina A., Deneer V.H., Maitland-van der Zee A.H. et al. Application of routine electronic health record databases for pharmacogenetic research. J Intern Med, 2014, 275 (6): 590-604.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Hua Tang, Tom Quertermous, Beatriz Rodriguez, et al. Genetic Structure, Self-Identified Race/Ethnicity, and Confounding in Case-Control Association Studies. Am. J. Hum. Genet, 2005, 76: 268-275.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Hua Tang, Tom Quertermous, Beatriz Rodriguez, et al. Genetic Structure, Self-Identified Race/Ethnicity, and Confounding in Case-Control Association Studies. Am. J. Hum. Genet, 2005, 76: 268-275.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
