<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">phgenomics</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Фармакогенетика и фармакогеномика</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Pharmacogenetics and Pharmacogenomics</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2588-0527</issn><issn pub-type="epub">2686-8849</issn><publisher><publisher-name>LLC "Izdatelstvo OKI"</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.37489/2588-0527-2020-2-12-13</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">phgenomics-195</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ФАРМАКОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>PHARMACOGENETICS STUDY</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Полиморфизм гена NAT2 в риске развития туберкулёза с множественной лекарственной устойчивостью при ВИЧ-инфекции</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title></trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Мальцева</surname><given-names>Н. В.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Новокузнецк</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Викторова</surname><given-names>И. Б.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Новокузнецк</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Казанцева</surname><given-names>О. М.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Новокузнецк</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Ханин</surname><given-names>А. Л.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Новокузнецк</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff xml:lang="ru" id="aff-1"><institution>НГИУВ — филиал ФГБОУ ДПО РМАНПО Минздрава России</institution><country>Russian Federation</country></aff><pub-date pub-type="collection"><year>2020</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>24</day><month>02</month><year>2021</year></pub-date><volume>0</volume><issue>2</issue><fpage>12</fpage><lpage>13</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Мальцева Н.В., Викторова И.Б., Казанцева О.М., Ханин А.Л., 2021</copyright-statement><copyright-year>2021</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Мальцева Н.В., Викторова И.Б., Казанцева О.М., Ханин А.Л.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Мальцева Н.В., Викторова И.Б., Казанцева О.М., Ханин А.Л.</copyright-holder><license license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.pharmacogenetics-pharmacogenomics.ru/jour/article/view/195">https://www.pharmacogenetics-pharmacogenomics.ru/jour/article/view/195</self-uri><abstract><p>.</p></abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>полиморфизм гена NAT2</kwd><kwd>туберкулёз</kwd><kwd>ВИЧ</kwd><kwd>противотуберкулёзные препараты</kwd><kwd>множественная лекарственная устойчивость</kwd></kwd-group></article-meta></front><body><p>Введение. Высокая частота регистрации множественной лекарственной устойчивости (МЛУ) Mycobacterium tuberculosis (МБТ) при туберкулёзе (ТБ) у больных ВИЧ-инфекцией даёт основания полагать, что ТБ с МЛУ МБТ (МЛУ-ТБ) ассоциирован с положительным ВИЧ-статусом, а ВИЧ-инфекция может рассматриваться в качестве независимого фактора риска формирования МЛУ-ТБ. Среди вероятных причин такой ассоциации рассматриваются высокий риск инфицирования резистентными формами МБТ в условиях социальной дезадаптации больных ВИЧ-инфекцией [<xref ref-type="bibr" rid="cit1">1</xref>], мальабсорбция рифампицина [<xref ref-type="bibr" rid="cit2">2</xref>] и особенности фармакокинетики других противотуберкулёзных препаратов [<xref ref-type="bibr" rid="cit3">3</xref>]. В метаболизме некоторых из них принимают участие ферменты — продукты экспрессии гена N-ацетилтрансферазы2 NAT2 [<xref ref-type="bibr" rid="cit4">4</xref>].</p><p>Цель. Целью настоящей работы явилось исследование распределения частот встречаемости генотипов NAT2 при МЛУ-ТБ у пациентов с ВИЧ-инфекцией.</p><p>Материалы и методы. В исследование включены 70 больных коинфекцией ВИЧ и туберкулёз (ВИЧ/ТБ) в возрасте от 24 до 54 (36,17±0,784) лет: — 43 (61 %) мужчины в возрасте от 27 до 49 (35,79±0,833) лет и 27 (39 %) женщин в возрасте от 24 до 54 (36,78±1,557) лет, находившихся на стационарном лечении в ГКУЗ Кемеровской области «Новокузнецком клиническом противотуберкулёзном диспансере» г. Новокузнецка в период 2017—2019 гг. Из них МЛУ МБТ обнаружена у 47 пациентов в возрасте от 24 до 54 (35,85±0,982) лет, мужчин — 28 (60 %) человек в возрасте от 27 до 48 (35,5±0,985) лет и женщин — 19 (40 %) в возрасте от 24 до 54 (36,37±1,981) лет. Фенотипическое определение лекарственной чувствительности (ЛЧ) МБТ к препаратам основного (изониазид, рифампицин, этамбутол, стрептомицин) и резервного (канамицин, офлоксацин, этионамид, капреомицин, циклосерин и ПАСК) рядов проводилось методом абсолютных концентраций на плотных питательных средах Левенштейна — Йенсена. Генотипическая экспресс-диагностика МЛУ МБТ проводилась с использованием GeneXpert MTB/RIF выявлением в биологическом материале (мокроте) ДНК МБТ и мутации в гене rpoB, ответственной за резистентность к рифампицину (маркер МЛУ). Лекарственная чувствительность к противотуберкулёзным препаратам была установлена у 23 больных ВИЧ/ТБ (ЛЧ-ТБ). МЛУ МБТ (резистентность одновременно к изониазиду и рифампицину) была обнаружена у 47 (67,1 %) пациентов, а в 12 случаях имелась дополнительная резистентность к фторхинолонам. Дополнительными критериями включения в исследование были проведение противотуберкулёзной терапии [<xref ref-type="bibr" rid="cit5">5</xref>] и согласие пациентов на участие в исследовании. Медиана количества CD4-лимфоцитов составила во всей выборке 177,0 клеток/мкл (диапазон 9,0—1624,0 клеток/мкл), у пациентов с МЛУ-ТБ — 189,0 клеток/мкл (диапазон 50,0— 1624,0 клеток/мкл), при ЛЧ-ТБ — 157,0 клеток/мкл (диапазон 9,0—930,0 клеток/мкл).</p><p>Для выделения образцов геномной ДНК у каждого больного забирали по 3 мл цельной венозной крови из локтевой вены в стандартные пробирки, содержащие ЭДТА-K3 (IMPROVE, China). ДНК выделяли с помощью коммерческого реагента «ДНК-экспресс-кровь» (НПФ «Литех», Москва). Генотипирование проводили по полиморфным локусам гена N-ацетилтрансферазы2 —NAT2Lys268Arg A803G rs1208, NAT2Arg197Gln G590A rs1799930 и NAT2Leu161Leu C481T rs1799929 — с помощью коммерческих комплектов реагентов «SNP-экспресс» (НПФ «Литех», Москва). Статистическая обработка результатов проводилась с использованием программ Microsoft® Excel® версия 14.4.6 (141106), Statistica 6.0, InStatII, SPSS.</p><p>Результаты. Распределение частот генотипов всех тестируемых полиморфных локусов гена NAT2 соответствовало равновесию Харди—Вайнберга (р&gt;0,05). Отличие от указанного равновесия по локусу NAT2G590A выявлено при МЛУ-ТБ (р&lt;0,05).</p><p>Более половины пациентов с МЛУ-ТБ (66 %) являлись носителями NAT2G590G. Соответственно, риск развития МЛУ-ТБ в сравнении с ЛЧ-ТБ у обследованных пациентов с генотипом NAT2G590G оказался высоким (OR=3,63, р=0,02), а риск развития ЛЧ-ТБ — низким (OR=0,27, р=0,02). У гетерозигот NAT2G590A выявлен сниженный риск развития МЛУ-ТБ (OR=0,28, р=0,03) и существенная предрасположенность к развитию ЛЧ-ТБ (OR=3,57, р=0,03). По двум другим полиморфизмам NAT2A803G и NAT2C481T отличий в частотах аллелей и генотипов между когортами с МЛУ-ТБ и ЛЧ-ТБ не обнаружено. Однако сочетание диких генотипов NAT2A803A × NAT2G590G встречалось у трети пациентов с МЛУ-ТБ (33 %) и всего лишь у 1 (4 %) из 23 обследованных больных с лекарственно-чувствительным ТБ. Выявлен 10,65-кратный риск развития МЛУ-ТБ у носителей данного сочетания (р=0,0134) и, соответственно, очень низкая вероятность развития ЛЧ-ТБ (OR=0,09, р=0,0071). Одновременное носительство дикого генотипа по третьему исследованному локусу NAT2C481T (сочетание генотипов NAT2A803A × NAT2G590G × NAT2C481C) не было обнаружено ни у одного пациента в случаях ЛЧ-ТБ. Поэтому вероятность развития МЛУ-ТБ у носителей повысилась до OR=10,78 (р=0,04).</p><p>Заключение. Выявлена ассоциация полиморфных локусов NAT2Lys268Arg A803G rs1208, NAT2Arg197Gln G590A rs1799930 и NAT2Leu161Leu C481T rs1799929 с риском развития МЛУ-ТБ у больных ВИЧ-инфекцией. Селекция в организме резистентных мутантных штаммов M. tuberculosis может быть более успешной при генотипе быстрых метаболизаторов. Поэтому данный генотип может быть предрасполагающим к развитию множественной лекарственной устойчивости M. tuberculosis, что, несомненно, требует подтверждения в дальнейших исследованиях.</p></body><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Conaty SJ, Hayward AC, Story A et al. Explaining risk factors for drug-resistant tuberculosis in England and Wales: contribution of primary and secondary drug resistance. Epidemiol. Infect. 2004;132(6):1099-1108. DOI: 10.1017/S0950268804002869.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Conaty SJ, Hayward AC, Story A et al. Explaining risk factors for drug-resistant tuberculosis in England and Wales: contribution of primary and secondary drug resistance. Epidemiol. Infect. 2004;132(6):1099-1108. DOI: 10.1017/S0950268804002869.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Patel KB, Belmonte R, Crowe HM. Drug malabsorption and resistant tuberculosis in HIV-infected patients. N Engl J Med. 1995;332(5):336-7. DOI: 10.1056/NEJM199502023320518.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Patel KB, Belmonte R, Crowe HM. Drug malabsorption and resistant tuberculosis in HIV-infected patients. N Engl J Med. 1995;332(5):336-7. DOI: 10.1056/NEJM199502023320518.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Van Oosterhout JJ, Dzinjalamala FK, Dimba A et al. Pharmacokinetics of antituberculosis drugs in HIV-positive and HIV-negative adults in Malawi. Antimicrob Agents Chemother. 2015;59(10):6175-80. DOI: 10.1128/AAC.01193-15.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Van Oosterhout JJ, Dzinjalamala FK, Dimba A et al. Pharmacokinetics of antituberculosis drugs in HIV-positive and HIV-negative adults in Malawi. Antimicrob Agents Chemother. 2015;59(10):6175-80. DOI: 10.1128/AAC.01193-15.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Mthiyane T, Millard J, Adamson J et al. N-Acetyltransferase 2 Genotypes among Zulu-Speaking South Africans and Isoniazid and N-Acetyl-Isoniazid Pharmacokinetics during Antituberculosis Treatment. Antimicrob Agents Chemother. 2020;64(4):e02376-19. DOI: 10.1128/AAC.02376-19.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Mthiyane T, Millard J, Adamson J et al. N-Acetyltransferase 2 Genotypes among Zulu-Speaking South Africans and Isoniazid and N-Acetyl-Isoniazid Pharmacokinetics during Antituberculosis Treatment. Antimicrob Agents Chemother. 2020;64(4):e02376-19. DOI: 10.1128/AAC.02376-19.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Федеральные клинические рекомендации по диагностике и лечению туберкулеза у больных ВИЧ-инфекцией, 2015 г. http://roftb.ru/netcat_ﬁles/doks2016/rec2016.pdf</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Federal clinical guidelines for the diagnosis and treatment of tuberculosis in patients with HIV infection, 2015. (In Russ). http://roftb.ru/netcat_ﬁles/doks2016/rec2016.pdf</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
