<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">phgenomics</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Фармакогенетика и фармакогеномика</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Pharmacogenetics and Pharmacogenomics</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2588-0527</issn><issn pub-type="epub">2686-8849</issn><publisher><publisher-name>LLC "Izdatelstvo OKI"</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.37489/2588-0527-2020-2-4-5</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">phgenomics-191</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ФАРМАКОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>PHARMACOGENETICS STUDY</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Исследование роли мутации в гене SLC6A1 в развитии шизофрении in vitro</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title></trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Букина</surname><given-names>Е. С.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Москва</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Артюхов</surname><given-names>А. С.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Москва</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Кондратьев</surname><given-names>Н. В.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Москва</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-3"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Карпов</surname><given-names>Д. С.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Москва</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-4"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Абашкин</surname><given-names>Д. А.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Москва</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-5"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Дашинимаев</surname><given-names>Э. Б.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Москва</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-6"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Козин</surname><given-names>С. В.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Москва</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff xml:lang="ru" id="aff-1"><institution>ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России</institution><country>Russian Federation</country></aff><aff xml:lang="ru" id="aff-2"><institution>ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова</institution><country>Russian Federation</country></aff><aff xml:lang="ru" id="aff-3"><institution>ФГБНУ Научный центр психического здоровья</institution><country>Russian Federation</country></aff><aff xml:lang="ru" id="aff-4"><institution>ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова; ФГБНУ Научный центр психического здоровья; ФГБУН Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук (ИМБ РАН)</institution><country>Russian Federation</country></aff><aff xml:lang="ru" id="aff-5"><institution>ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова; ФГБНУ Научный центр психического здоровья</institution><country>Russian Federation</country></aff><aff xml:lang="ru" id="aff-6"><institution>ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова; ФГБУН Институт биологии развития им. Н.К. Кольцова РАН</institution><country>Russian Federation</country></aff><pub-date pub-type="collection"><year>2020</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>24</day><month>02</month><year>2021</year></pub-date><volume>0</volume><issue>2</issue><fpage>4</fpage><lpage>5</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Букина Е.С., Артюхов А.С., Кондратьев Н.В., Карпов Д.С., Абашкин Д.А., Дашинимаев Э.Б., Козин С.В., 2021</copyright-statement><copyright-year>2021</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Букина Е.С., Артюхов А.С., Кондратьев Н.В., Карпов Д.С., Абашкин Д.А., Дашинимаев Э.Б., Козин С.В.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Букина Е.С., Артюхов А.С., Кондратьев Н.В., Карпов Д.С., Абашкин Д.А., Дашинимаев Э.Б., Козин С.В.</copyright-holder><license license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.pharmacogenetics-pharmacogenomics.ru/jour/article/view/191">https://www.pharmacogenetics-pharmacogenomics.ru/jour/article/view/191</self-uri><abstract><p>.</p></abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>шизофрения</kwd><kwd>мутации</kwd><kwd>ген SLC6A1</kwd></kwd-group></article-meta></front><body><p>Введение. Шизофрения — это полиморфное полигенное психическое заболевание с не до конца изученным патогенезом [<xref ref-type="bibr" rid="cit1">1</xref>], понимание механизмов развития которого позволит разработать новые подходы к лечению. Клиническая картина шизофрении неоднозначна: под диагнозом «шизофрения» объединён ряд отдельных синдромов, отличающихся в том числе и генетическим бэкграундом [<xref ref-type="bibr" rid="cit1">1</xref>]. При этом заболевании выделяют позитивные, негативные и когнитивные симптомы, выраженность которых может существенно варьировать. На данный момент наиболее успешным подходом к лечению шизофрении является медикаментозная терапия антипсихотиками, которая не всегда даёт желаемый эффект в связи с клинической гетерогенностью заболевания.</p><p>Одним из подходов при разработке новых лекарств является использование для доклинических исследований клеточных моделей in vitro. Однако в случае психических заболеваний это затруднено изза ограниченного доступа к клеткам головного мозга. Животные модели недостаточно адекватны из-за межвидовых различий в строении нервной системы. В связи с этим широкое распространение получили модели на основе индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (ИПСК) [<xref ref-type="bibr" rid="cit2">2</xref>]. ИПСК, полученные из фибробластов кожи пациентов, могут быть дифференцированы в нейральном направлении in vitro и затем использованы для исследования патогенеза шизофрении.</p><p>Существуют разные подходы к оценке генетической предрасположенности к развитию шизофрении. Оценка полигенного риска — наличие полиморфизмов, ассоциированных с развитием того или иного полигенного заболевания (шизофрении в том числе), — базируется на результатах полногеномного поиска ассоциаций [<xref ref-type="bibr" rid="cit3">3</xref>]. Однако помимо полиморфизмов в генетическую архитектуру шизофрении вносят вклад вариации числа копий генов, редкие мутации и эпимутации, которые могут возникать de novo [<xref ref-type="bibr" rid="cit4">4</xref>]. Для их выявления часто используют подход, основанный на сравнении геномных последовательностей у пробандов и их здоровых родителей (в так называемых тройках). В нашем распоряжении есть фибробласты кожи, полученные от больного шизофренией с мутацией в гене SLC6A1, ассоциированной с развитием заболевания, и его здоровых родителей. Ген SLC6A1 кодирует транспортер гамма аминомаслянной кислоты (ГАМК), отвечающий за обратный захват ГАМК из синаптической щели. Использование моделей in vitro на основе ИПСК даёт возможность изучать влияние отдельных мутаций, в частности de novo мутации в гене SLC6A1 на характеристики нервной ткани и в дальнейшем разрабатывать подходы к персонализированному лечению.</p><p>Цель. Изучить влияние мутации de novo в гене SLC6A1, кодирующем обратный транспортер ГАМК, на патогенез шизофрении.</p><p>Для достижения данной цели были поставлены следующие задачи:</p><p>Материалы и методы. Выделение геномной ДНК из культур клеток человека: фенол-хлороформная экстракция; амплификация гена SLC6A1 с помощью количественного метода ПЦР; секвенирование по Сенгеру (аутсорс); получение плазмид, содержащих гены Яманаки (аутсорс); наработка плазмиды: трансформация плазмиды в компетентные клетки (Escherichia coli), посев на чашки Петри на агар с ампициллином, постановка ночной культуры, выделение плазмиды набором MiniPrep (Евроген); упаковка плазмид в лентивирусы и их дальнейшее концентрирование в концентраторе центрифужном Amicon; лентивирусная трансдукция культур фибробластов родителей и пробанда; морфологический анализ ИПСК: микроскопия; анализ специфических маркеров ИПСК: покраска селективными антителами; проверка уровня экспрессии специфических маркеров ИПСК: выделение РНК и обратная транскрипция (набор ExtractRNA (Евроген), согласно инструкции производителя), синтез кДНК (набор MMLV RT (Евроген), согласно инструкции производителя), ПЦР в реальном времени (ПЦР-анализу подвергалась кДНК, полученная в ходе обратной транскрипции, для определения уровней экспрессии маркеров ИПСК в исследуемых клетках); тест на функциональную активность: способность дифференцироваться в три зародышевых листка.</p><p>Результаты. С помощью секвенирования по Сенгеру было подтверждено наличие исследуемой мутации в гене SLC6A1 в геноме пробанда, и отсутствие этой мутации в геномах родителей.</p><p>На данный момент мы находимся на этапе получения ИПСК из фибробластов кожи пробанда и родителей: получены лентивирусные трансдукты, которыми были заражены культуры фибробластов пробанда и родителей.</p><p>Заключение. Поскольку на данный момент патогенез шизофрении до конца не ясен, таргетных препаратов для её лечения нет. Однако возможность получения ИПСК из фибробластов пациентов и дифференцировка их в нейроны позволят изучать механизмы развития заболевания с учётом индивидуальных различий и эффективнее проводить скрининг препаратов для таргетной терапии и генной терапии в том числе.</p></body><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Fromer M, Pocklington AJ, Kavanagh DH et al. De novo mutations in schizophrenia implicate synaptic networks. Nature. 2014;506(7487):179-184. DOI: 10.1038/nature12929</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Fromer M, Pocklington AJ, Kavanagh DH et al. De novo mutations in schizophrenia implicate synaptic networks. Nature. 2014;506(7487):179-184. DOI: 10.1038/nature12929</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Busskamp V, Lewis NE, Guye P et al. Rapid neurogenesis through transcriptional activation in human stem cells. Mol Syst Biol. 2014;10:760. DOI: 10.15252/msb.20145508</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Busskamp V, Lewis NE, Guye P et al. Rapid neurogenesis through transcriptional activation in human stem cells. Mol Syst Biol. 2014;10:760. DOI: 10.15252/msb.20145508</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Bush WS, Moore JH. Chapter 11: Genome-wide association studies. PLoS Comput Biol. 2012;8(12):e1002822. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1002822</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Bush WS, Moore JH. Chapter 11: Genome-wide association studies. PLoS Comput Biol. 2012;8(12):e1002822. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1002822</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Sullivan PF, Daly MJ, O’Donovan M. Genetic architectures of psychiatric disorders: The emerging picture and its implications. Nat Rev Genet. 2012;13(8):537-551. DOI: 10.1038/nrg3240</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Sullivan PF, Daly MJ, O’Donovan M. Genetic architectures of psychiatric disorders: The emerging picture and its implications. Nat Rev Genet. 2012;13(8):537-551. DOI: 10.1038/nrg3240</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
